5株PCV2四川株全基因组的克隆与遗传进化分析

编号 zgly0001533150

文献类型 期刊论文

文献题名 5株PCV2四川株全基因组的克隆与遗传进化分析

作者 杨泽晓  马玉峰  汪开毓  王印  赵希仑  姚学萍  任冉阳  陈平  胡凌 

作者单位 四川农业大学动物医学院  动物疫病与人类健康四川省重点实验室  金宇保灵生物药品有限公司 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2016年04期

年份 2016 

分类号 S852.65 

关键词 PCV2  基因克隆  遗传进化分析 

文摘内容 【目的】了解目前四川省猪圆环病毒2型(PCV2)的分子流行病学特征和遗传变异情况,探讨PCV2感染的控制对策。【方法】根据GenBank中发表的PCV2基因组序列设计2对特异性引物,对2012-2014年临床送检的PCV2感染病例材料中的5株PCV2全基因组序列进行扩增测序,并利用DNAStar等生物信息分析软件对获得的PCV2基因组序列进行分子特性与遗传演变分析。【结果】5株PCV2四川株全基因组序列长度都为1 767bp,均具有滚环复制起点(ORC)典型结构。序列比对和进化分析显示,5株PCV2四川株的基因序列同源性很高,基因组核苷酸序列及ORF1、ORF2和ORF3基因序列同源性分别为98.4%~99.9%,97.5%~99.6%,99.4%~100%和96.2%~100%,ORF1、ORF2和ORF3基因推导氨基酸序列同源性分别为98.4%~99%,99.6%和91.5%~100%;与47条参比PCV2毒株核苷酸序列的同源性比较发现,5株PCV2与国内一些新出现的PCV2毒株亲缘关系较近,且均属于PCV2d基因型毒株。【结论】5株PCV2四川株之间尽管存在着不同程度的基因变异,但遗传进化相对较稳定。