食用菌纤维素内切酶的分子建模与分析

编号 zgly0000745175

文献类型 期刊论文

文献题名 食用菌纤维素内切酶的分子建模与分析

学科分类 220.1070;森林植物学

作者 黄婷婷  易卓林  茆灿泉 

作者单位 西南交通大学生命科学与工程学院/分子进化与应用生物学实验室 

母体文献 江西农业大学学报 

年卷期 2011,33(3)

页码 584-588

年份 2011 

分类号 Q71 

关键词 分子建模  纤维素内切酶  食用菌 

文摘内容 采用SWISS-MODEL、Discovery Studio等生物信息方法预测和分析食用菌纤维素内切酶(EG)分子的三级结构。结果显示: 草菇(V.volvacea)和云芝(T.hirsuta)EG的分子外形呈＂桶＂状,由外层的alpha-螺旋和内层的beta-折叠组成,无规卷曲位于其2个底面;草菇EG的R129作为盐键形成中心,参与形成6个盐键,其催化残基E215和E248参与形成5个氢键,而里氏木霉(T.reesei)EGII的催化残基参与形成3个氢键。基于EG连接区和催化相关序列氢键分析,认为草菇和云芝的该区域相关碱基或氨基酸可进行突变和优化。目前未见对草菇和云芝EG的分子建模的研究报道。此研究对于食用菌纤维素内切酶结构的深入了解和结构优化及应用具有重要的意义和价值。