太行菊NAC转录因子基因OpNAC1的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001639741

文献类型 期刊论文

文献题名 太行菊NAC转录因子基因OpNAC1的克隆及生物信息学分析

作者 梁芳  张燕  郝平安  崔波 

作者单位 郑州师范学院生物工程研究所  河南农业大学生命科学学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年11期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S567.239 

关键词 太行菊  NAC  基因克隆  生物信息 

文摘内容 NAC转录因子是植物中数量最大的转录因子,在植物的生长发育及各种逆境胁迫中发挥非常重要的作用。本研究以太行菊的叶片为研究材料,运用RT-PCR及RACE技术克隆得到一条太行菊的NAC基因完整的cDNA序列,命名为OpNAC1(GenBank登录号MF996370),并对其进行了生物信息学分析。分析表明,OpNAC1基因cDNA序列全长1 208 bp,ORF全长855 bp,编码284个氨基酸。预测其蛋白分子量32.68 kD,等电点6.46,属于不稳定亲水性蛋白。不含有信号肽和跨膜结构,很可能定位于细胞核。OpNAC1与菊花(ADQ20114.1)亲缘关系较近,同源性达93.7%。二级结构预测表明,OpNAC1蛋白由40个α-螺旋(14.08%)、47个β-折叠(16.55%)和197个无规则卷曲(69.37%)组成,与三级结构预测基本相符。研究结果为今后深入研究NAC转录因子在太行菊中的生物功能提供基础。