基于高通量测序的文冠果转录组分析

编号 zgly0000997921

文献类型 期刊论文

文献题名 基于高通量测序的文冠果转录组分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 敖妍  马履一  韩树文  杨晓辉 

作者单位 北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室  国家能源非粮生物质原料研发中心  河北省平泉县林业局  河北省平泉县国有黄土梁子林场 

母体文献 中国生物工程杂志 

年卷期 2015(7)

页码 22-29

年份 2015 

关键词 文冠果  花芽  Illumina Solexa  转录组  开花基因 

文摘内容 应用Illumina Hi-seqTM2000高通量测序技术对文冠果花芽进行转录组分析。共获得N50为1 180bp、平均长度为686bp的unigene 58 311条。与公共数据库Nr和Swiss-Prot同源性比较后发现37 047条unigene获得基因注释,另有21 264条unigene未被注释。利用COG数据库将unigene分成25类。通过GO分类和KEGG Pathway富集性分析,将unigene分别归类于55个GO term和128个代谢途径。