芍药转录因子PlWRKY40的克隆及表达分析

编号 zgly0001568413

文献类型 期刊论文

文献题名 芍药转录因子PlWRKY40的克隆及表达分析

作者 李俊杰  韩璐璐  马燕  姚汪劲松  国静  郭先锋 

作者单位 山东农业大学林学院  山东农业大学生命科学学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2017年04期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S682.12 

关键词 芍药  PlWRKY40  克隆  表达分析  亚细胞定位 

文摘内容 WRKY转录因子在植物休眠等生长发育过程中具有重要作用。本研究基于芍药芽转录组数据,对芽休眠解除前后显著下调的编号为c22608.graph_c0的序列进行了q PCR验证分析,结果表明其表达模式与转录组一致,说明其与芍药芽休眠解除密切相关。为进一步挖掘和利用该基因,从芍药‘大富贵’芽中克隆了该基因,命名为Pl WRKY40(Gen Bank登录号:KU891820)。其c DNA全长1 347 bp,开放阅读框882 bp,编码293个氨基酸,含有1个典型的WRKY结构域;基因结构分析表明,Pl WRKY40具有4个外显子和3个内含子,其内含子具有特殊结构,可能调控该基因表达;以拟南芥WRKY蛋白的分类为参照,聚类分析结果表明,Pl WRKY40属于Group IIa亚族;系统进化树分析表明,Pl WRKY40与可可Tc WRKY40具有最高的同源性;亚细胞定位观测结果显示,Pl WRKY40转录因子定位在细胞核上;半定量PCR分析显示,Pl WRKY40在芍药的不同组织器官中泛表达,其中芽表达量最高。本研究为深入探索Pl WRKY40的生理学功能奠定了基础。