从云南蚕区分离BmCPV病毒株的全基因组克隆与系统发育分析

编号 zgly0001486637

文献类型 期刊论文

文献题名 从云南蚕区分离BmCPV病毒株的全基因组克隆与系统发育分析

作者 张永红  唐芬芬  邵榆岚  朱峰  白兴荣 

作者单位 云南省农业科学院蚕桑蜜蜂研究所 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2015年06期

年份 2015 

分类号 S884.5 

关键词 家蚕质型多角体病毒  分离株  基因组片段  系统进化  RNA聚合酶基因  多角体蛋白基因 

文摘内容 家蚕质型多角体病毒(BmCPV)是家蚕中肠型脓病的病原物。从云南蚕区的病蚕样品中分离到一株BmCPV病毒分离株,提取纯化该病毒粒子的总RNA并合成cDNA,克隆病毒全基因组序列,研究该病毒分离株的基因组结构与系统进化。克隆得到该病毒10条dsRNA序列(S1~S10)并提交至NCBI数据库中。序列分析表明该病毒基因组序列全长24810bp,S1~S10片段序列都具有完整的ORF。BLAST比对发现克隆的该病毒基因组各片段编码区序列与已报道的1型BmCPV片段的相似度达88%以上,氨基酸序列相似度达90%以上;10条dsRNA基因组片段末端均有保守帽子结构5’-AGUAA……GUUAGCC-3’。基于S2片段RdRp基因的系统进化分析发现,该病毒与其他3个1型BmCPV分离株BmCPV1-Suzhou、BmCPV1-China、BmCPV1-Ⅰ聚为一支,基于S10片段polh基因的系统进化分析也表明该病毒为1型BmCPV新的分离株系。根据上述研究结果将该病毒定名为BmCPV1-Yunnan。