割手密过氧化氢酶基因(SsCAT-1)的克隆与比较分析

编号 zgly0001478460

文献类型 期刊论文

文献题名 割手密过氧化氢酶基因(SsCAT-1)的克隆与比较分析

作者 刘洋  姚艳丽  胡小文  徐磊  邢淑莲  张树珍 

作者单位 中国热带农业科学院湛江实验站  热带旱作农业研究中心  中国热带农业科学院热带生物技术研究所  甘蔗研究中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2014年06期

年份 2014 

分类号 S566.1 

关键词 割手密  过氧化氢酶  基因克隆  PCR验证 

文摘内容 割手密是栽培种甘蔗最重要的近缘物种之一,具有较强的抗逆性。本研究以高粱过氧化氢酶基因(NCBI登录号为XM002437586.1)c DNA序列为探针,对甘蔗EST数据库进行同源检索、筛选和拼接,后经基因组PCR、分子克隆、序列分析验证成功分离了2个割手密过氧化氢酶基因c DNA序列(Ss CAT-1c和Ss CAT-1d,Gene Bank登录号为KF864229和KF864230)。2条序列全长均为1 532 bp,包含10 bp的5’非翻译区(UTR)和43 bp的3’UTR,以及一个1 479 bp的开放读码框,编码492个氨基酸,此蛋白序列具有过氧化氢酶保守结构域,属于CAT家族。2条序列之间相似性为99.2%,存在12个单核苷酸多态性(SNP)位点,蛋白相似性99.0%,存在5个氨基酸变异位点。将推测的Ss CAT-1c和Ss CAT-1d蛋白序列与高粱、水稻、玉米等物种进行同源进化分析,均表现出极高的保守性。研究结果能对今后深入了解甘蔗及其近缘材料CAT基因家族的信息提供帮助,从而为进一步通过生物技术改良甘蔗品种抗逆性提供理论依据。