孟氏隐唇瓢虫qRT-PCR分析中内参基因的筛选

编号 zgly0001528201

文献类型 期刊论文

文献题名 孟氏隐唇瓢虫qRT-PCR分析中内参基因的筛选

作者 潘畅  张宇宏  庞虹 

作者单位 有害生物控制与资源利用国家重点实验室中山大学生命科学学院  广东省昆虫研究所广东省农业害虫综合治理重点实验室广东省野生动物保护与利用公共实验室 

母体文献 环境昆虫学报 

年卷期 2016年02期

年份 2016 

分类号 S476.2 

关键词 孟氏隐唇瓢虫  qRT-PCR  内参基因  表达稳定性  GeNorm软件  NormFinder软件  BestKeeper软件 

文摘内容 选择合适的内参基因是qRT-PCR研究的关键。本文以孟氏隐唇瓢虫Cryptolaemus montrouzieri Mulsant为研究材料,利用qRT-PCR技术,对孟氏隐唇瓢虫4个候选内参基因Actin、RPS23、GAPDH和β-tubulin的mRNA的表达量进行了分析,并用Ge Norm、Norm Finder和Best Keeper软件分析它们在孟氏隐唇瓢虫不同发育阶段及成虫不同组织中的表达稳定性。结果表明,以成虫不同组织为材料时,综合三种软件分析结果显示4个候选基因表达稳定性平均等级值排名为RPS23(rank=1)>β-tubulin(rank=2.3)>GAPDH(rank=3)>Actin(rank=3.7),以不同发育时期虫体为材料时,综合分析结果显示4个候选内参基因表达稳定性平均等级值排名为RPS23(rank=1.7)>Actin(rank=2)>GAPDH(rank=2.7)>β-tubulin(rank=3.7)。综合分析在瓢虫不同发育阶段及成虫不同组织两种处理下,三种软件的评价效果,4个候选基因表达稳定性等级值的总平均排名为RPS23(rank=1.3)>Actin(rank=2.8)=GAPDH(rank=2.8)>β-tubulin(rank=3)。RPS23在瓢虫不同发育阶段及成虫不同组织中均显示出较高的表达稳定性及与其它基因之间极大的相关性,可以确定为孟氏隐唇虫不同发育阶段及成虫不同组织基因表达分析中一个稳定表达的基因,可作为单个内参基因或者其它内参基因的协同基因,本实验为开展孟氏隐唇瓢虫功能基因表达分析奠定了方法学基础。