醉马草免培养内生细菌的多样性

编号 zgly0000759580

文献类型 期刊论文

文献题名 醉马草免培养内生细菌的多样性

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 张雪兵  史应武  曾军  娄恺 

作者单位 新疆农业科学院微生物应用研究所  新疆农业大学食品学院 

母体文献 生态学报 

年卷期 2011,31(8)

页码 2178-2187

年份 2011 

分类号 Q939 

关键词 醉马草  内生细菌  免培养法  生物多样性 

文摘内容 为了解醉马草内生细菌的组成和多样性,采用液氮研磨法提取醉马草总DNA,利用内生细菌16S rRNA基因特异性引物对醉马草总DNA进行16S rRNA基因扩增,构建醉马草内生细菌16S rRNA基因文库。对筛选到249个克隆进行HaeШ酶切分析,得到57个操作分类单元(OTUs)。系统发育分析将其归为4个门: 变形杆菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)以及1个未知类群。其中74%的克隆与可培养细菌中的37个属具有高的16SrRNA基因序列相似性(97%—100%),其中芽孢杆菌属(Bacillus spp.)、红球菌属(Rhodococcus spp.)、黄杆菌属(Flavobacterium spp.)、黄单胞杆菌属(Xanthomonas spp.)最为丰富。另外26%的克隆序列与GenBank中已存细菌16S rRNA基因序列相似性小于96%。研究结果表明,醉马草中可培养内生细菌丰富,多样并且可能存在一些潜在新物种或新类群。