新疆沙湾冷泉沉积物的细菌系统发育多样性

编号 zgly0001375767

文献类型 期刊论文

文献题名 新疆沙湾冷泉沉积物的细菌系统发育多样性

作者 曾军  杨红梅  徐建华  吴江超  张涛  孙建  娄恺 

作者单位 新疆农业科学院微生物应用研究所  新疆大学生命科学与技术学院  新疆农业大学食品科学与工程学院 

母体文献 生态学报 

年卷期 2010年21期

年份 2010 

分类号 Q93 

关键词 冷泉  地下水生态系统  细菌多样性  免培养法 

文摘内容 为了解新疆沙湾冷泉沉积物的细菌群落组成与类群多样性,利用免培养方法直接从沙湾冷泉沉积物中提取环境总DNA,构建细菌16S rRNA基因文库。对随机挑选的241个细菌阳性克隆子进行HaeIII酶切分型得到86个可操作分类单元(OTUs),系统发育分析将其归为11个门:放线菌门(Actinobacteria),酸杆菌门(Acidobacteria),拟杆菌门(Bacteroidetes),绿菌门(Chlorobi),蓝细菌门(Cyanobacteria),厚壁菌门(Firmicutes),芽单胞菌门(Gemmatimonadetes),硝化螺旋菌门(Nitrospirae),变形菌门(Proteobacteria),浮霉菌门(Planctomycetes),疣微菌门(Verrucomicrobia)。其中酸杆菌门和变型菌门为优势类群,分别占细菌克隆文库的48%和25%。超过1/3的OTUs序列与GenBank中已存序列具有较低相似性(相似性小于95%)。此外20%左右的克隆子与固氮细菌和硝酸盐氧化细菌相关。研究结果表明,新疆沙湾冷泉沉积物中细菌种类丰富,代谢类型多样而且存在大量未知类群。