小麦蓝矮病植原体核糖体蛋白rpl22和rps3的生物信息学分析

编号 zgly0001392966

文献类型 期刊论文

文献题名 小麦蓝矮病植原体核糖体蛋白rpl22和rps3的生物信息学分析

作者 吴宽  颜永杰  李蓓  武科科 

作者单位 西北大学信息科学与技术学院  西北大学生命科学学院  西北农林科技大学植物保护学院 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2010年06期

年份 2010 

分类号 S435.121.49 

关键词 小麦蓝矮病植原体  生物信息学  核糖体蛋白  序列分析 

文摘内容 【目的】将生物信息学方法应用于小麦蓝矮病植原体(WBD)的分类研究,确定了小麦蓝矮病植原体的分类地位。【方法】应用植原体核糖体蛋白(rp)基因通用引物对rpF1/rpR1,对WBD进行PCR扩增并得到特异片段,对特异片段进行测定及同源性分析。【结果】序列测定结果表明,WBDrp基因片段长1 240 bp,包含部分rps19基因和全部的rpl22和rps3基因,且后2个基因为重叠基因,分别编码129和252个氨基酸,rpl22和rps3蛋白的等电点分别为12.605和11.755。【结论】WBD与16SrⅠ-C亚组中三叶草绿变病(Clover phyllody)的KVE、KVG、CPh株系亲缘关系最近,核苷酸同源性依次为99.7%,99.6%和99.0%,WBD与KVE株系的rpl22和rps3基因编码的氨基酸同源性分别为100%和98%,因此将小麦蓝矮病植原体划归到16SrⅠ-C亚组。