环境微生物宏基因组学研究中的生物信息学方法

编号 zgly0000979515

文献类型 期刊论文

文献题名 环境微生物宏基因组学研究中的生物信息学方法

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 魏子艳  金德才  邓晔 

作者单位 中国科学院生态环境研究中心中国科学院环境生物技术重点实验室  中国科学院大学 

母体文献 微生物学通报 

年卷期 2015(5)

页码 890-901

年份 2015 

关键词 环境微生物  宏基因组学  生物信息学  高通量测序 

文摘内容 高通量测序技术的发展促进了组学技术在环境微生物研究中的广泛应用,而宏基因组学是目前最为关键和成熟的组学方法。生物信息学在微生物宏基因组学研究中具有至关重要的作用。它贯穿于宏基因组学的数据收集和存储、数据处理和分析等各个阶段,既是宏基因组学推广的最大瓶颈,也是目前宏基因组学研究发展的关键所在。本文主要介绍和归纳了目前在高通量宏基因组测序中常用的生物信息学分析平台及其重要的信息分析工具。未来几年之内,测序成本的下降和测序深度的增加将进一步增大宏基因组学研究在数据存储、数据处理和数据挖掘层面的难度,因此相应生物信息学技术与方法的研究和发展也势在必行。