扁桃SFB基因的克隆及其生物信息学分析

编号 zgly0001357210

文献类型 期刊论文

文献题名 扁桃SFB基因的克隆及其生物信息学分析

作者 郭长奎  罗淑萍  何天明  李疆  高启明 

作者单位 新疆农业大学农学院  新疆农业大学林学与园艺学院  新疆农业大学特色果树研究中心 

母体文献 果树学报 

年卷期 2009年02期

年份 2009 

分类号 S662.9 

关键词 扁桃  自交不亲和  SFB基因  生物信息学 

文摘内容 以新疆扁桃栽培品种麻壳的花药为材料,利用RT-PCR和RACE技术,克隆到了一个全长为1131bp的SFB基因(Genbank登录号为:EU909685),命名为AcSFB10。该基因编码376个氨基酸,在N末端含有一个大约50个氨基酸组成的F-box基序。经生物信息学分析,推测AcSFB10蛋白的分子式为C2000H3033N517O558S23,相对分子质量为43985.5,等电点为6.02,二级结构以α螺旋为主;理论推导半衰期大约为30h,不稳定参数为53.21,属于不稳定蛋白;并且推测此蛋白为亲水性、非分泌型蛋白,在基质内起裂合酶的作用,特异性的识别底物,正好吻合了F-box蛋白的作用。