葡萄CHS和STS基因家族生物信息学鉴定和表达分析

编号 zgly0001528741

文献类型 期刊论文

文献题名 葡萄CHS和STS基因家族生物信息学鉴定和表达分析

作者 袁华招  赵密珍  吴伟民  于红梅  王庆莲 

作者单位 江苏省农业科学院园艺研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2016年04期

年份 2016 

分类号 S663.1 

关键词 葡萄  CHS  STS  果实发育 

文摘内容 查尔酮合成酶(CHS,chalcone synthase)是植物体类黄酮类化合物合成的第1个关键酶和限速酶,它能够催化丙二酰-Co A和对香豆酸-Co A合成柚皮素查尔酮。二苯乙烯合成酶(STS,stilbene synthase)是芪类化合物合成路径的关键酶,与查尔酮合成酶有共同的作用底物,二者具有很高的相似度。为更好地了解葡萄中CHS和STS基因的种类和数量,本研究采用生物信息学方法检索获得葡萄(Vitis vinifera L.)基因组数据库中的CHS和STS基因,通过分析其染色体定位、系统进化和保守基序,发现葡萄基因组可能含有33个STS基因,9个CHS基因,这些基因集中分布在6条葡萄染色体上,部分家族基因在染色体上形成基因簇。葡萄CHS和STS基因家族蛋白长度、基因结构和蛋白基序非常保守,具有很近的进化关系。葡萄芯片数据结果表明,葡萄CHS和STS基因在葡萄果实不同发育时期的果皮和果肉中均有表达,尤其葡萄CHS GroupsⅢ亚家族基因在葡萄果皮中大量表达。葡萄STS基因家族在果实中的表达量较低,部分探针在葡萄果实成熟期的果皮中表达量急剧增加。本研究结果可为葡萄CHS和STS基因在果实发育过程中的功能研究提供参考。