犬冠状病毒V1株膜蛋白基因的克隆与序列分析

编号 zgly0001276336

文献类型 期刊论文

文献题名 犬冠状病毒V1株膜蛋白基因的克隆与序列分析

作者 乔军  夏咸柱  胡桂学  谢之景  闫芳  杨松涛  黄耕 

作者单位 中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所  吉林农业大学动物科技学院  中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所 吉林长春130062  吉林长春130062  吉林长春130118  吉林长春130062 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2004年12期

年份 2004 

分类号 S852.65 

关键词 犬冠状病毒  膜蛋白基因  基因克隆  序列分析 

文摘内容 根据GenBank中报道的CCVInsavc 1株核蛋白基因(M)序列,用特异性引物对分离的CCVV1野毒株进行了RT PCR扩增,将扩增得到的PCR片段纯化后与pGEM T连接得到重组质粒pTM,并进行了核苷酸序列测定。结果表明,该基因全长为789bp,编码263个氨基酸,其中前17个氨基酸为信号肽。与CCV标准毒株Insavc 1M基因相比,两者核苷酸的同源性为92.1%;推导的氨基酸序列同源性为90.9%,差异主要发生在该蛋白的N端前1/3区域内。在推导的M蛋白氨基酸序列中,发现了3个明显的疏水区,提示该蛋白可能是一个反复跨膜的蛋白;在N端15～17,38～40,234～236位氨基酸存在3个潜在的N 联糖基化位点,可能是形成该蛋白表面抗原决定基的位点。另外,推导蛋白氨基酸序列的疏水性和抗原表位与Insavc 1株M蛋白存在一定差异,提示两者免疫原性可能有差别。