红树植物秋茄中受盐胁迫抑制的cyclophilin基因的鉴定与表达分析

编号 zgly0000305460

文献类型 期刊论文

文献题名 红树植物秋茄中受盐胁迫抑制的cyclophilin基因的鉴定与表达分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 黄薇  林栖凤  李冠一  赵文明 

作者单位 西安交通大学生命科学与技术学院 

母体文献 实验生物学报 

年卷期 2003,36(3)

页码 209-214

年份 2003 

分类号 Q943 

关键词 红树  秋茄  亲环素  cDNA  盐胁迫  基因抑制  鉴定  表达 

文摘内容 利用代表性差异分析方法获得秋茄中两个编码亲环素(cyclophilin)蛋白的cDNA片段(称为SRGKC2和SRGKC3)，该片段大小分别为282bp和160bp；序列分析表明：SRGKC2和SRGKC3是同一基因区域的不同长度片段，SRGKC3是SRGKC2片段的一部分。SRGKC2在84个氨基酸范围内与大戟属cyclophilin蛋白的氨基酸序列的一致性达到90％，SRGKC3在47个氨基酸范围内与蚕豆cyclophilin蛋白的一致性达到93％。Northern分析表明：盐分抑制SRGKC2片段的表达。依赖SRGKC2片段的序列资料，利用cDNA快速末端扩增(RACE)技术获取秋茄中cyclophilin基因的全长cDNA片段(命名为KCCYP1)(GenBank登录号：AY150052)。该cDNA全长约为0．9kb，含有一个516个核苷酸的完整开放阅读框，编码172个氨基酸，等电点为8．57，分子量18．2KDa。42—49位氨基酸残基为推测的ATP／GTP结合位点A基序(P—loop)，48—54位氨基酸残基是插入的7个氨基酸残基。文中还对SRGKC2在不同种中的表达状况进行了分析。