红松查尔酮合成酶基因CHS密码子偏好性分析

编号 zgly0001706393

文献类型 期刊论文

文献题名 红松查尔酮合成酶基因CHS密码子偏好性分析

作者 李翔  范作义  王井源  王淇  李喜鹏  王德秋  孔令远  曹森林  孟庆刚  赵曦阳 

作者单位 林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学林学院  吉林省临江林业局 

母体文献 植物研究 

年卷期 2020年03期

年份 2020 

分类号 S791.247 

关键词 红松  查尔酮合成酶  密码子偏好性  聚类分析 

文摘内容 查尔酮合成酶(Chalcone synthase,CHS)广泛存在于植物体内,是花色素形成过程中一种重要的酶,可以进一步催化生成黄酮类化合物。本研究采用Codon W和EMBOSS在线软件对红松查尔酮合成酶基因CHS的密码子使用偏好性进行分析,并与北美乔松等其他24种植物的CHS基因以及模式植物基因组进行比较,对认识红松CHS基因的密码子使用偏好性,为选择适宜的表达系统奠定了一定的基础。研究结果表明:红松CHS基因编码区的有效密码子数(ENC)和GC含量分别为48.92和0.548,C+G含量高于A+T含量,密码子偏好以A/T结尾;多数植物CHS基因的G+C含量高于A+T含量,且密码子更偏好C/G结尾;聚类分析表明,红松与马尾松和赤松的密码子使用偏好性的相似性较高;密码子使用频率研究发现,红松CHS遗传转化与异源表达较优的受体可能是大肠杆菌和拟南芥。