家蚕微孢子虫的一个Dicer相似蛋白基因的鉴定及系统进化和转录活性分析

编号 zgly0001495791

文献类型 期刊论文

文献题名 家蚕微孢子虫的一个Dicer相似蛋白基因的鉴定及系统进化和转录活性分析

作者 王玲  何承民  党晓群  许金山  周泽扬 

作者单位 重庆师范大学生命科学学院  家蚕基因组生物学国家重点实验室 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2015年01期

年份 2015 

分类号 S884.6 

关键词 家蚕微孢子虫  Dicer相似蛋白基因  系统进化  共线性  RNA干扰  基因转录 

文摘内容 Dicer是一种具有RNaseⅢ酶活性的蛋白质,参与RNAi起始阶段siRNA和miRNA的形成,为RNA诱导沉默复合物(RISC)形成的关键因子之一,在基因的转录后调控中扮演重要角色。采用生物信息学方法从家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)全基因组数据中鉴定到一个Dicer相似蛋白(Dicer-like)基因,命名为Nb DCL(Gen Bank登录号:EOB15391)。预测Nb DCL的二级结构中含有RNaseⅢ结构域和dsRNA结合结构域。基于Dicer-like基因的系统进化分析显示,家蚕微孢子虫与柞蚕微孢子虫(Nosema pernyi)的亲缘关系最近,并与真菌形成姊妹枝,说明微孢子虫Dicer-like与真菌的同源基因来自共同的祖先。基因组共线性分析显示,Dicer-like基因及其两侧基因在微孢子虫基因组中的排列顺序具有显著的保守性,但兔脑炎微孢子虫(Encephalitozoon cuniculi)和比氏肠道微孢子虫(Enterocytozoon bieneusi)基因组中的Dicer-like基因在物种分化过程中发生了丢失。对Dicer-like基因和Agronaute相似蛋白基因、转座子的共存分析表明,家蚕微孢子虫等Nosema属微孢子虫均保留了古老的RNAi作用机制。RT-PCR检测被家蚕微孢子虫感染48~240 h的家蚕幼虫中肠中Nb DCL基因均有转录。研究结果为进一步探究家蚕微孢子虫RNAi的调控机制提供了有益线索。