杂交鲟和匙吻鲟HSP70 cDNA克隆与序列分析

编号 zgly0000702071

文献类型 期刊论文

文献题名 杂交鲟和匙吻鲟HSP70 cDNA克隆与序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 高宇  袁改玲  李大鹏  陈昌福 

作者单位 华中农业大学水产学院 

母体文献 华中农业大学学报 

年卷期 2010(1)

页码 85-89

年份 2010 

分类号 Q959.463 

关键词 热应激蛋白HSP70  杂交鲟  匙吻鲟  克隆  序列分析 

文摘内容 采用RT-PCR法从杂交鲟(♀Husohuso×♂Acipenser schrencki)和匙吻鲟(Polyodon spnthula)肝脏RNA克隆获得HSP70基因的全长cDNA(HSP70cDNA)。所测定的HSP70cDNA序列与NCBI/GenBankt登载的鲫(GenBank No.DQ872648)同源性最高, 杂交鲟和匙吻鲟分别达96%和98%, 杂交鲟HSP70序列为382bp, 匙吻鲟为334bp。将杂交鲟和匙吻鲟与其它脊椎动物HSP70氨基酸序列用DNAstar软件进行相似度比较, 鱼类与哺乳动物、两栖类非洲爪蟾之间HSP70氨基酸序列相似度平均值分别为86.2%和86.8%。鱼类之间的氨基酸序列相似度较大, 平均为93.8%, 表现出较高的保守性。以HSP70核苷酸序列为分子标记, 用MEGA4软件中最大简约法(MP)构建了12个物种HSP70系统发育树, 识别出3个大的单系类群: 杂交鲟、匙吻鲟、团头鲂、鲫、鲤、斑马鱼聚为类群一(bootstrap96); 虹鳟和大西洋鲑聚为类群(bootstrap100); 人类和褐家鼠类聚为类群三(bootstrap89)。