果子蔓凤梨Actin基因的克隆与序列分析

编号 zgly0000649968

文献类型 期刊论文

文献题名 果子蔓凤梨Actin基因的克隆与序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘建新  葛亚英  田丹青  张智  丁华侨  沈福泉  王炜勇 

作者单位 浙江省农业科学院花卉研究开发中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2011,9(1)

页码 41-45

年份 2011 

分类号 S852.659.6 

关键词 果子蔓凤梨  Actin  克隆 

文摘内容 持家基因Actin常被用作定量、半定量PCR试验的内参,以确定目标基因的相对表达量。基于前期从全长cDNA文库中获得Actin基因的EST单克隆,进行Primer Walking测序,获得一个Actin基因的全长cDNA序列,序列长1625bp,ORF为1131bp,可编码377个蛋白氨基酸,命名为Goactin1(GenBank登录号: HQ184438)。蛋白质理论分子质量为41.7kD,等电点pI为5.31,包含一个Actin superfamily保守区,二级结构主要由随机卷曲、Alpha螺旋、延伸链和Beta转角组成。此外以2BTF A链为基础建立起了Goactin1蛋白的三级结构图。系统进化树分析表明Goactin1蛋白与马铃薯、棉花、烟草、短柄草、拟南芥等的Actin蛋白聚为一类,它们的亲缘关系最近。