青藏高原东南部山丹nrDNA ITS和cpDNA petB/petD序列的分子进化特点

编号 zgly0001577705

文献类型 期刊论文

文献题名 青藏高原东南部山丹nrDNA ITS和cpDNA petB/petD序列的分子进化特点

作者 蒋福娟  唐楠  唐道城  巨秀婷  孙静清 

作者单位 青海大学高原花卉研究中心/青海省园林植物与观赏园艺重点实验室  大通县林业局  青海省高原作物种质资源创新与利用国家重点实验室培育基地  西宁市人民公园 

母体文献 植物研究 

年卷期 2018年01期

年份 2018 

分类号 Q943.2 

关键词 青藏高原东南部  山丹  ITS  petB/petD  分子进化 

文摘内容 采用改良CTAB法提取青藏高原东南部山丹25个居群所有个体的基因组DNA,选取核基因ITS和叶绿体pet B/pet D区域进行PCR扩增、纯化和测序。对所有序列对位排列,其中ITS序列总长696 bp,变异位点有4处,共产生7种单倍型,变异位点百分率为0.72%,(G+C)含量60.4%;pet B/pet D序列总长616 bp,仅1处变异位点和2种单倍型,变异位点百分率为0.16%,(G+C)含量34.6%。表明山丹中,pet B/pet D区域较ITS序列保守,变异速率较慢。对ITS序列单倍型进行失配分布和中性检验分析发现,山丹现有分布范围可能经历了近期居群小范围扩张,AMOVA分析发现山丹居群的遗传变异主要存在于居群内,NST>GST(P>0.01),表明山丹的遗传变异有着不显著的谱系地理结构。因此,山丹ITS序列适合该种的谱系地理学研究。