龙眼TIR1和ABP1基因的克隆及其在体胚发生过程中的表达分析

编号 zgly0000794946

文献类型 期刊论文

文献题名 龙眼TIR1和ABP1基因的克隆及其在体胚发生过程中的表达分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 李惠华  赖钟雄  苏明华  林玉玲 

作者单位 福建农林大学园艺植物生物工程研究所  福建省亚热带植物研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2012,39(2)

页码 253-264

年份 2012 

分类号 S667.2 

关键词 龙眼  胚性愈伤组织  生长素受体基因  生长素结合蛋白基因  克隆  序列分析  实时荧光定量PCR法 

文摘内容 采用RT-PCR结合RACE法,分离克隆龙眼(Dimocarpus longan Lour.)胚性愈伤组织生长素受体基因TIR1(Transport inhibitor response 1,即DL-TIR1)和生长素结合蛋白基因ABP1(Auxin biding protein 1,即DL-ABP1),运用生物信息学方法对序列进行分析,并通过实时荧光定量PCR法研究其在龙眼体细胞胚胎(以下简称龙眼体胚)发生过程中的表达。结果表明: DL-TIR1为2328bp的mRNA全长序列(GenBank,GQ870264),包含1个长为1761bp的开放阅读框,5′非编码区为118bp,3′非编码区为449bp,推定的氨基酸序列含586个氨基酸,与其它植物TIR1具有85%～57%同源性;DL-TIR1在龙眼体胚的各阶段均有表达,整个变化趋势呈近似＂W＂状,在子叶形胚中的表达量最高。DL-ABP1为869bp的mRNA全长序列(GenBank,GQ900592),包含1个长为567bp的开放阅读框,5′非编码区为43bp,3′非编码区为259bp;推定的氨基酸序列含188个氨基酸,与其它植物ABP1具有87%～72%同源性,DL-ABP1在龙眼体胚中整个表达变化趋势也呈现近似＂W＂状。生长素受体DL-TIR1和＂可能的＂生长素受体DL-ABP1在龙眼体胚中的变化趋势极为相似。