砂梨扩展蛋白基因cDNA克隆及全序列分析

编号 zgly0000583136

文献类型 期刊论文

文献题名 砂梨扩展蛋白基因cDNA克隆及全序列分析

作者 宋长年  乔玉山  章镇  胡钟东  渠慎春  熊爱生  姚泉洪 

作者单位 南京农业大学园艺学院果讨生物技术研究室  上海市农业科学院牛物技术研究所 

母体文献 果树学报 

年卷期 2008,25(2)

页码 166-171

年份 2008 

分类号 S665.1 

关键词 砂梨  扩展蛋白  分子克隆  序列分析 

文摘内容 设计植物EXP扩展蛋白简并引物，以砂梨果实cDNA为模板，克隆得到EXP基凼cDNA片段，该片段长465bp。根据该片段序列，分别设计2条5’和3’末端扩增的特异引物，利用RACE技术，获得了该片段的5’端和3’端序列。用DNAMAN5＋22软件对3个序列进行拼接和分析，获得了该基凶的cDNA全长，命名为Pyp—EXP。该cDNA全长为1395bp，5’端起始密码子ATG始于72bp．3’端终止子TAG止于830bp，Ploy＋(A)从1363～1395bp。该基因已在GenBank基因数据库注册，注册号为EF602031。Pyp-EXP核苷酸序列有一。个759bp完整的开放阅读框。编码区与西洋梨、苹果、湖北海棠、桃的同源性分别为96％，96％，94％和86％；该cDNA推导编码252个氨基酸，含有1个组氨酸(His_Phe_Asp，HFD)功能域，与两洋梨、苹果、湖北海棠、桃中相应序列同源性分别为98％，97％，95％和93％。该基因的克隆为研究扩展蛋白的时卒表达及其在果实发育和成熟过程中的作用奠定了基础。