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基于amy基因的中国野桑蚕遗传多样性及其与家蚕的系统发育关系



编号 zgly0001360735

文献类型 期刊论文

文献题名 基于amy基因的中国野桑蚕遗传多样性及其与家蚕的系统发育关系

作者 杜周和  刘俊凤  刘斌彬  董占鹏  余泉友  鲁成  陈义安 

作者单位 西南大学蚕学与系统生物学研究所  四川省农业科学院蚕业研究所  云南省农业科学院蚕蜂研究所  重庆大学农学院 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2009年12期

年份 2009 

分类号 Q961  S881 

关键词 家蚕  野桑蚕  遗传多样性  系统发育  淀粉酶基因 

文摘内容 为探索中国野桑蚕Bombyx mandarina的遗传多样性及其与家蚕B.mori的系统发育关系,采用PCR产物直接测序法(少数样本克隆测序)获得34个家蚕和野桑蚕样本淀粉酶基因amy序列片段(715bp)。分析发现56个多态性位点,鉴定出28种单倍型(haplotype);核苷酸多样性π=0.01390±0.00103,单倍型多样度Hd=0.988±0.011。核苷酸不配对分析(mismatchan alysis)和Fu’sFs检测表明中国野桑蚕曾发生过种群扩张。分子方差分析(AMOVA)表明,遗野桑蚕传差异主要在种群内,种群间和地理组群间差异不显著。聚类树上34个样本聚为3枝/3蔟,野蚕和家蚕都不按地理区域或系统(类型)聚类,A枝由来自不同地区的野蚕和不同类型的家蚕混合构成,并且进一步分成3个亚枝,每一亚枝也同时包含家蚕和野蚕,B枝由3个家蚕和1个野蚕混合构成,C枝全部由来自不同地区的野蚕构成。网络分析没有发现祖先单倍型和优势单倍型。结果提示,淀粉酶基因是一个多态性丰富的分子标记,中国野桑蚕遗传多样性十分丰富,据此推测家蚕起源于多种生态类型混杂的野桑蚕。

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