陕西秦巴山区野桑蚕线粒体COⅠ序列的遗传多样性与系统进化分析

编号 zgly0001712441

文献类型 期刊论文

文献题名 陕西秦巴山区野桑蚕线粒体COⅠ序列的遗传多样性与系统进化分析

作者 孟刚  彭云武  王瑞娴  楚渠  梁嘉俊  凌君 

作者单位 安康学院陕西省蚕桑重点实验室  安康学院现代农业与生物科技学院 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2020年07期

年份 2020 

分类号 S885.9 

关键词 野桑蚕  遗传多样性  聚类分析  秦巴山区 

文摘内容 【目的】分析野桑蚕（Bombyx mandarina）的遗传多样性,为发掘和利用其基因资源提供参考。【方法】克隆8份秦巴野桑蚕线粒体COⅠ序列,联合GenBank中39份家蚕、17份野桑蚕COⅠ序列,用DnaSP 5.0软件统计核苷酸多样性和单倍型多样性,采用MEGA X软件构建系统发育树,Network 5.0软件构建单倍型中介网络。基于64份COⅠ序列进行聚类分析,分析遗传多样性和单倍型中介网络,探讨家蚕起源。【结果】克隆了8份秦巴野桑蚕线粒体COⅠ及其侧翼序列,序列长1 531 bp,序列间存在18处核苷酸变异,定义了4个单倍型,8份秦巴野桑蚕与沈阳、青州等北方野桑蚕亲缘关系最近。系统发育树将64份线粒体COⅠ序列聚为4个类群,其中中国野桑蚕聚为2个类群,一是来自陕西、辽宁、山东等的北方野桑蚕,与家蚕遗传距离为0.007 21;二是来自江苏、湖北、重庆等的南方野桑蚕,与家蚕遗传距离为0.019 59;日本野桑蚕群体与家蚕遗传距离为0.031 96。64份COⅠ序列共存在84处单碱基变异位点,定义了31种单倍型。单倍型中介网络图显示,31种家蚕、野桑蚕单倍型总体上可分为3个支系,其中单倍型H22可能为家蚕祖先单倍型。【结论】秦巴山区野桑蚕与北方省份的野桑蚕亲缘关系最近,秦巴山区可能是家蚕驯化的起源地之一。