椰子基因组DNA的提取及SSR反应体系的优化

编号 zgly0000583001

文献类型 期刊论文

文献题名 椰子基因组DNA的提取及SSR反应体系的优化

作者 吴翼  武耀廷  马子龙 

作者单位 中国热带农业科学院椰子研究所  中国热带农业科学院热带生物技术研究所 

母体文献 中国农学通报 

年卷期 2008,24(3)

页码 417-422

年份 2008 

分类号 S667.4 

关键词 椰子  DNA提取  SSR  优化 

文摘内容 以马哇、文椰78F1和海南高种为试材,利用改良的CTAB法提取的基因组DNA纯度高,完整性好。将PCR体系的主要成分设定5个梯度,根据每个成分的变化引起的PCR-SSR的效果差异,探讨了椰子SSR技术中PCR体系的主要成分对扩增结果的影响,并对引物co007的适宜退火温度进行优化。最终确定了引物co007的最适退火温度为46.4～54℃,20μlPCR反应体系的最佳条件为：Mg2＋浓度为2.0～4.0mmol/L,dNTPs的浓度为0.1～0.25mmol/L,Taq聚合酶用量为1.0～2.0U,引物浓度为0.5～2.0μmol/L。利用此反应体系对部分椰子品种进行PCR扩增并电泳检测,扩增结果清晰且有较高的多态性,表明该体系适合椰子的亲缘关系分析。