影响H5N1甲型流感病毒对哺乳动物毒力变异的HA序列关键位点研究

编号 zgly0000408723

文献类型 期刊论文

文献题名 影响H5N1甲型流感病毒对哺乳动物毒力变异的HA序列关键位点研究

作者 许慧琳  张文彤  赵耐青  姜庆五 

作者单位 复旦大学公共卫生学院卫生统计与社会医学教研室  复旦大学公共卫生学院流行病学教研室 

母体文献 世界感染杂志 

年卷期 2006,6(5)

页码 473-473

年份 2006 

分类号 R373.1 

关键词 H5N1亚型  氨基酸位点  甲型流感病毒  毒力变异  基因序列  哺乳动物  HA1  生物学作用 

文摘内容 目的筛选影响H5N1亚型甲型流感病毒对哺乳动物毒力变异的HA序列主要氨基酸位点。方法根据相关文献提供的实验结果, 将54株H5N1病毒株按其对哺乳动物的毒力强弱分为高毒力组和低毒力组, 在NCB□Genbank数据库中下载HA基因序列, 用随机森林模型完成主要变异氨基酸位点的筛选。结果在HA序列中共筛选出8个关键位点, 均位于HA1节段, 分别为: 279、102、228、156、154、172、140、8。位点154和156与其余几个关键位点间、位点140与172间均存在较强的协同交互作用, 用上述关键位点重建的随机森林模型对病毒株毒力分类的准确率为83.33%。结论所筛选出的8个变异位点可能在决定H5N1病毒毒力上起关键作用, 值得对其分子生物学作用机理做深入研究。