鳚亚目(Blennioidei)鱼类的线粒体COI基因序列比较

编号 zgly0001710572

文献类型 期刊论文

文献题名 鳚亚目(Blennioidei)鱼类的线粒体COI基因序列比较

作者 陈博锦  王伟  孙鹏飞  牟玉双  王月  魏艳超 

作者单位 大连海洋大学水产与生命学院辽宁省北方鱼类应用生物学与增养殖重点实验室 

母体文献 经济动物学报 

年卷期 2020年02期

年份 2020 

分类号 S917.4 

关键词 鳚亚目鱼类  COI  基因序列  分子系统发生树 

文摘内容 应用生物信息学方法对12种鳚亚目鱼类线粒体COI基因序列片段进行了比较分析。结果表明:COI基因碱基组成偏倚明显,A+T含量(54.40%)明显高于G+C含量(45.60%)。转换和颠换位点数分别为59和42个。应用Kimura双参数法计算鳚亚目鱼类COI基因序列的种间遗传距离,结果表明:种间平均遗传距离为0.232 4,是种内遗传距离的9.62倍。应用MP和NJ法构建了分子系统发生树,结果显示,方氏云鳚、云鳚和六线鳚聚在一起,然后与颈鳍脂鳚聚在一起,再与巴西拟隆胎鳚、巴哈马拟隆胎鳚聚类,最后与疣眼吉氏指鰧聚类;粗头岩游鳚、环项副鳚和横带斯氏脂胎鳚聚为另一分支;背叉触角鳚并没有聚成一个单系分支,而是与旗鳚科和三鳍鳚科的鱼类交叉。此外,分子系统发生树的构建结果大部分与形态学分类结果相一致,相比之下,NJ法较MP法构建的分子系统发生树与鳚亚目鱼类形态学分类结果更接近。