涉案偶蹄目动物DNA条形码构建

编号 zgly0001721888

文献类型 期刊论文

文献题名 涉案偶蹄目动物DNA条形码构建

作者 刘大伟  侯森林  周用武  费宜玲  何建 

作者单位 南京森林警察学院野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室国家林业和草原局森林公安司法鉴定中心 

母体文献 南京林业大学学报(自然科学版 

年卷期 2020年06期

年份 2020 

分类号 S863  D918 

关键词 偶蹄目  DNA条形码  物种鉴定  COI  Cytb  基因片段 

文摘内容 【目的】利用线粒体DNA条形码标记鉴定涉案偶蹄目动物,为解决偶蹄目动物残体、制品的鉴定难题提供技术参考。【方法】对16个偶蹄目动物物种共67份样本,采用试剂盒提取DNA,扩增、测定物种的线粒体DNA的COI基因、Cyt b基因片段;在GenBank上Blast搜索进行同源性分析;利用MEGA 7.0软件分别比较这两个基因片段种内和种间遗传距离,构建系统发育树。【结果】在同源性分析中,西伯利亚狍(Capreolus pygargus)的Cyt b基因片段与GenBank中西伯利亚狍、欧洲狍(Capreolus capreolus)基因序列的同源性均为99.64%～99.82%,该片段不能区分西伯利亚狍与欧洲狍这两个近缘种。其余测序结果与数据库中参考序列一致且相似度较高。对于COI片段,种内遗传距离为0～1.4%,种间遗传距离为1.8%～18.8%。对于Cyt b基因片段种内遗传距离为0～0.5%,种间遗传距离为4.0%～15.8%。两个片段的种内遗传差异均小于种间遗传差异,存在较为明显的条形码间隔。COI和Cyt b基因片段的系统发育树中,同物种的不同个体均能形成具有较高支持度的单分支;不同物种之间界限清晰,每个物种的所有个体均能够形成具有较高支持度的单分支。【结论】基于COI和Cyt b基因片段构建的DNA条形码均可用于对涉案偶蹄目动物的物种鉴定。在物种鉴定中,可采用两个片段联合使用的方式,尤其是对于近缘种的鉴定,以降低错误风险。