蜡梅花转录组数据分析及次生代谢产物合成途径研究

编号 zgly0001412543

文献类型 期刊论文

文献题名 蜡梅花转录组数据分析及次生代谢产物合成途径研究

作者 杨楠  赵凯歌  陈龙清 

作者单位 华中农业大学园艺林学学院 

母体文献 北京林业大学学报 

年卷期 2012年S1期

年份 2012 

分类号 S685.99 

关键词 蜡梅  转录组  基因注释  次生代谢途径 

文摘内容 蜡梅是特产于我国的具有优良观赏性状的传统花卉,除了用于园林绿化外,还具有重要的药用价值。蜡梅的分子生物学研究开展较晚,基因数据库资源极少。本文采用Illumina GAIIx高通量测序——转录组测序(RNA-seq)技术对蜡梅花进行转录组测序,获得了超过3.8Gb的数据。将获得的Unigene与4个基因数据库进行比较,并对Unigene进行功能预测。结果表明,蜡梅花转录组数据库中的Unigene可归纳到43个GO聚类中,其中有大量的基因与代谢过程、催化反应、结合过程和细胞进程相关。代谢途径的分析有助于对基因生理功能的预测,库中31142个Unigene可定位到266个不同的代谢分支中。对蜡梅花转录组的组装和功能注释获得了大量转录本信息,为蜡梅的分子生物学研究提供了宝贵的基因组数据来源。基于蜡梅花的生理特性,初步探索利用蜡梅花转录组数据库研究次生代谢产物,分析转录组数据库中与花香、花色、生物碱合成途径相关的基因,发掘蜡梅研究开发应用新领域。