麻疯树磷酸烯酮式丙酮酸羧化酶pepc基因全长cDNA克隆及序列分析

编号 zgly0000729113

文献类型 期刊论文

文献题名 麻疯树磷酸烯酮式丙酮酸羧化酶pepc基因全长cDNA克隆及序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 范正琪  李纪元  田敏  李辛雷  陈东亮  卢孟柱 

作者单位 中国林业科学研究院亚热带林业研究所  中国林业科学研究院林业研究所 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2010(3)

页码 349-354

年份 2010 

分类号 S718.46 

关键词 麻疯树  pepc基因  克隆 

文摘内容 应用RT-PCR和RACE法从麻疯树总RNA中分离出pepc基因全长cDNA,长度为3 142 bp,阅读框2 898 bp,编码965个氨基酸,在GenBank中登录,序列号为EU069413。它的氨基酸序列与蓖麻、陆地棉、橙、大豆、花生、烟草、油菜、拟南芥的氨基酸同源性分别为94.94%、92.46%、90.60%、90.50%、90.50%、88.33%、84.61%、82.44%。该基因编码了pepc基因家族中的pepc1,蛋白属于C3型PEPC。推测了pepc编码蛋白分子量为110.6 kD,并对其稳定性、二级结构、疏水性等特性进行了分析,最后确定了该蛋白的功能位点和结构域。