基于EST-SSR标记的南方型黑杨主栽无性系鉴定及亲缘关系分析

编号 zgly0001683543

文献类型 期刊论文

文献题名 基于EST-SSR标记的南方型黑杨主栽无性系鉴定及亲缘关系分析

作者 袁佳秋  田野  洑香香 

作者单位 南方现代林业协同创新中心南京林业大学林学院 

母体文献 植物研究 

年卷期 2019年05期

年份 2019 

分类号 S792.11 

关键词 南方型杨树  EST-SSR标记  无性系鉴定  多态性 

文摘内容 以南方型黑杨引进后主栽区重点推广栽植的12个无性系为研究对象,利用EST-SSR分子标记进行多态性分析,并建立无性系鉴定的指纹图谱,为优良黑杨无性系的推广提供依据。用EST-trimmer对NCBI数据库中的EST序列进行分析、MISA软件找出SSR位点后运用primer 3在线设计获得的30对EST-SSR引物,对12个黑杨无性系进行PCR扩增。经过筛选获得18对多态性引物,对12个黑杨无性系进行扩增获得88个等位基因,多态率为70. 5%,平均观察等位基因数为2. 146 3,平均Shannon’s多样性指数为0. 592 7。通过5对引物组合(EU147、EU43、EU11、EU164和EU81)可以将12个黑杨无性系进行区分,并在此基础上构建指纹图谱。亲缘关系分析发现无性系间的遗传相似系数为0. 602 0～0. 904 0,平均值为0. 769 1;无性系间的遗传距离较近,与其均来源于美洲黑杨和欧美杨的相似遗传背景有关。总之,EST-SSR标记可以对南方型黑杨主栽无性系进行有效鉴定。