刺芹侧耳不同发育时期的转录组差异分析

编号 zgly0001655896

文献类型 期刊论文

文献题名 刺芹侧耳不同发育时期的转录组差异分析

作者 李帆  陈利丁  艾柳英  刘云超  闫苗  孙淑静 

作者单位 福建农林大学生命科学学院  福建农林大学(古田)菌业研究院 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2018年12期

年份 2018 

分类号 S646 

关键词 刺芹侧耳  比较转录组学  不同生长发育时期  差异表达基因  代谢途径 

文摘内容 为了探讨刺芹侧耳子实体生长发育时期的基因表达变化,本文利用高通量测序技术对刺芹侧耳不同发育时期(菌丝期、原基期、子实体时期)进行RNA-Seq分析,在转录水平上解析差异表达基因在刺芹侧耳生长发育过程中的作用和功能。KEGG功能富集显示,菌丝期差异表达基因主要富集在碳代谢和氨基酸代谢中,其中三羧酸循环中编码柠檬酸合酶、乌头酸水合酶、异柠檬酸脱氢酶、琥珀酰辅酶A合成酶、琥珀酸脱氢酶、苹果酸脱氢酶的基因表达量均上调,说明碳代谢和氨基酸代谢是菌丝时期的主要能量来源;原基期上调的差异表达基因主要富集在脂肪酸代谢,其中RT-PCR定量结果显示原基期编码脂肪酸合酶的基因和编码脂酰辅酶A合成酶的基因下调,编码超氧化物酶的基因和编码过氧化氢酶的基因上调,表明脂肪酸代谢和抗氧化酶对刺芹侧耳原基期维持机体的稳定和生物应激方面起着重要作用。子实体时期上调的差异表达基因主要富集在剪接体、类固醇的生物合成以及AMPK信号通路中,说明环境因子对子实体时期有一定的影响。