基于全基因组SNP的贵州久安古茶树遗传关系分析

编号 zgly0001660309

文献类型 期刊论文

文献题名 基于全基因组SNP的贵州久安古茶树遗传关系分析

作者 郭燕  乔大河  杨春  李燕  陈正武  陈娟 

作者单位 贵州省农业科学院茶叶研究所 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2019年01期

年份 2019 

分类号 S571.1 

关键词 古茶树  SNP  遗传结构  进化关系 

文摘内容 贵州久安分布着大量的古茶树资源。为了明晰这些茶树资源间的遗传关系,本研究以分布于久安5个不同区域的100份古茶树为材料,首先利用GBS(genotyping by sequencing)技术对它们的全基因组SNP进行了鉴定,然后基于鉴定到的SNP进行了系统进化树构建、主成分分析以及遗传结构分析。100份古茶树材料共获得548597个高质量SNP,并对这些SNP进行了变异类型注释。系统进化树、主成分分析以及遗传结构分析的结果高度一致,结果表明同一区域内的材料间亲缘关系较近;100份资源可以分为3个类群;古茶园(G)的材料与其他4个区域的材料遗传背景差异较大,这4个区域的资源可能有相同的亲本来源。