黄鳍鲷基因组微卫星的分离

编号 zgly0000503919

文献类型 期刊论文

文献题名 黄鳍鲷基因组微卫星的分离

作者 夏军红  朱彩艳  苏天凤  江世贵 

作者单位 中国水产科学研究院南海水产研究所 

母体文献 中国水产科学 

年卷期 2007,14(2)

页码 321-325

年份 2007 

分类号 Q959.483 

关键词 黄鳍鲷  基因组  微卫星 

文摘内容 采用磁珠富集法构建黄鳍鲷(Acnnthopagrus latus Houttuyn)基因组微卫星富集文库。共挑选60个克隆进行测序, 分析发现58个克隆分别含(GA)n或(CA)n两碱基重复单元。进一步通过序列比对, 最终获得41个具有特异微卫星序列的阳性克隆。其中, 23个克隆含有(GA)n或(CT)n两碱基重复序列, 17个克隆含有(GT)。或(CA)n重复序列, 另1个含有以上两种重复类型。获得的微卫星序列中, 单一型及间断型序列各有20条, 另有1条属于复合型序列。序列长度为117～512bp,平均259bp。微卫星核心序列两碱基重复5到38次, 绝大多数序列重复次数大于10。基于微卫星两端的侧翼序列设计并获得了3对能够在黄鳍鲷基因组有效扩增的微卫星引物。本研究旨为进一步开展黄鳍鲷分子育种及资源评价分析提供基础资料。