日本扁柏核基因组微卫星的分离与鉴定

编号 zgly0000328110

文献类型 期刊论文

文献题名 日本扁柏核基因组微卫星的分离与鉴定

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 李新国  田金菊  谷尚树  津村义彦 

作者单位 北京林业大学生物技术系 

母体文献 遗传学报 

年卷期 2004,31(4)

页码 375-379

年份 2004 

分类号 S718.46 

关键词 日本扁柏  微卫星  基因组  测序 

文摘内容 以日本扁柏4个种源的DNA样品为材料, 经NdeⅡ酶切并电泳后回收300～1000bp DNA片段, 与含有生物素标记的(CT)15探针杂交, 再用磁珠(Dynabeads M280 streptavitin beads)固定杂交产物, 成功地实现了日本扁柏核基因组微卫星的高效分离。以pUC118 BamH Ⅰ/BAP为载体, E.coli如为寄主, 构建了日本扁柏2个富含微卫星的基因组文库, 共获得2200多个阳性克隆。从构建的基因组文库中, 随机挑选480个阳性克隆进行测序, 发现含有微卫星的克隆比例高达65.6%, 其中215个非同源性克隆共含有380个微卫星位点, 平均每个克隆含1.7个。微卫星种类以与探针(CT)15互补的(GA/CT)。为主, 占86.1%, 同时还存在(TG/AC)。和3～4个碱基为单元构成的微卫星, 如(ATAG)n、(CAGA)n、(TGA)n、(ACG)n、(TCA)n、(TCT)n等。利用Oligo5.1软件为114个含有微卫星的克隆共128个微卫星位点设计出了PCR扩增引物。