结肠癌基因表达谱的特征选取研究

编号 zgly0000789580

文献类型 期刊论文

文献题名 结肠癌基因表达谱的特征选取研究

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 潘冬寅  朱发  徐昇  业宁 

作者单位 南京林业大学信息科学与技术学院 

母体文献 山东大学学报: 工学版 

年卷期 2012,42(2)

页码 23-29

年份 2012 

分类号 TP391.4 

关键词 特征选择  Chernoff距离  浮动顺序搜索  支持向量机  K-近邻  径向基神经网络 

文摘内容 为了找到与结肠癌相关的基因,提高结肠癌样本的识别率,提出了基于Chernoff距离的浮动顺序搜索算法(sequential floating search method,SFSM)。通过对结肠癌基因表达谱数据集的分析,对每个基因进行评价和筛选;对筛选后的基因子集利用SFSM算法进行搜索,并以Chernoff距离作为其评估函数,生成若干候选特征基因子集;利用支持向量机(support vector machine,SVM)、K-近邻(K-nearest neighbor,KNN)和径向基(radical basis function,RBF)神经网络分类器来检验候选特征基因子集的分类效果。实验结果表明,利用SFSM及评估函数Chernoff距离发现在参数β=0.25时能找到最佳的特征基因组合,该组合能以很高的正确率识别结肠癌样本。