菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析

编号 zgly0001722907

文献类型 期刊论文

文献题名 菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析

作者 阮城城  胡福初  罗志文  王祥和  郭利军  李玉静  范鸿雁  韩冰  陈哲  张治礼 

作者单位 海南省农业科学院热带果树研究所·海南省热带果树生物学重点实验室·农业部海口热带果树科学观测实验站  海南大学热带作物学院 

母体文献 果树学报 

年卷期 2020年11期

年份 2020 

分类号 S668.3 

关键词 菠萝  TCP基因  基因家族  表达分析 

文摘内容 【目的】筛选并分析菠萝TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating)基因家族,为菠萝TCP基因在乙烯利诱花过程中的功能研究提供参考。【方法】以‘台农16号’菠萝为材料,通过生物信息学软件系统地分析该基因家族的蛋白质理化性质、染色体定位、基因共线性、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及RNA-Seq数据,并通过qRTPCR分析该基因家族在成花诱导阶段的表达情况。【结果】共鉴定出9个菠萝TCP基因,均含有TCP结构域,系统进化将其划分为PCF、CIN和CYC/TB1三个亚家族。菠萝TCP基因家族的扩增与全基因组倍增事件无关,不存在片段复制和串联复制事件。启动子顺式作用元件分析发现,AcTCP2、AcTCP5～AcTCP9均含有乙烯响应元件。表达谱分析表明,AcTCP对乙烯利均有不同程度的响应,在花芽分化时期,AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在茎尖中的表达水平均有显著上调,分别约为0时期的8.15、18.0、14.6和7.91倍。【结论】鉴定并分析了AcTCP基因家族成员信息,发现AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在花芽分化时期高度表达,AcTCP3在乙烯利处理1 h后显著上调,表明其可能与乙烯利诱导菠萝成花过程密切相关。