鸮形目4种鸟类线粒体调控区全序列的测定与比较研究

编号 zgly0000474161

文献类型 期刊论文

文献题名 鸮形目4种鸟类线粒体调控区全序列的测定与比较研究

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 肖冰  马飞  孙毅  李庆伟 

作者单位 辽宁师范大学生命科学学院  厦门大学生命科学学院 

母体文献 遗传学报 

年卷期 2006,33(11)

页码 965-974

年份 2006 

分类号 Q943 

关键词 鸮形目  线粒体基因组  调控区  重复序列 

文摘内容 利用Long-PCR和Primer Walking的方法对鸮形目的短耳鸮、长耳鸮、纵纹腹小鸮、灰林鸮4种鸟类的线粒体调控区进行了全序列测定。结果表明: 短耳鸮的调控区跃度为3290bp; 长耳鸮为2848bp; 纵纹腹小鸮为2444bp; 灰林鸮为1771bp。短耳鸮的调控区长度是4种鸮中最大的, 并且是目前已知最大的鸟类线粒体调控区。这4种鸮类调控区的基本结构和其他鸟类相似, 按照碱基变化速率的不同可以分为3个区: 碱基变化速率较快的外围区域Ⅰ、Ⅲ和保守的中间区域Ⅱ。这4种鸟类调控区的3’端均存在大量的串联重复序列, 短耳鸮为126bp单元重复7次和78bp单元重复14次; 长耳鸮为127bp单元重复8次和78bp单几重复6次; 纵纹腹小鸮有3个重复单元, 分别为89bp单元重复3次、77bp单元重复4次和71bp单元重复6次; 灰林鸮仅有1个单元的串联重复为78bp重复5次。调控区中串联重复序列可能是由链的滑动错配产生, 另外这些重复序列都能形成热力学稳定的多重茎环二级结构, 而且在重复序列中还发现一些保守基序, 这说明重复序列可能具有一定的生理功能, 影响调控区的调重控功能从而影响线粒体基因组的复制和转录。