白桦漆酶BpLAC1基因生物信息学分析

编号 zgly0001542500

文献类型 期刊论文

文献题名 白桦漆酶BpLAC1基因生物信息学分析

作者 冯连荣  宋立志  赵大根  王玉成  池玉杰 

作者单位 东北林业大学林学院  辽宁省杨树研究所 

母体文献 南方林业科学 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 S792.153 

关键词 白桦  漆酶  LAC1基因  生物信息学分析 

文摘内容 为了深入了解白桦漆酶BpLAC1基因的功能,利用生物信息学方法对其结构域及功能进行预测,包括开放阅读框分析、信号肽预测、基本理化性质分析、糖基化位点预测、保守结构域分析、系统进化分析、蛋白质二级及三级结构预测。结果如下:BpLAC1基因序列全长为1 677 bp,开放阅读框ORF长为1 677 bp,编码558个氨基酸,蛋白相对分子量为58.6 k Da,理论等电点为9.53,是稳定的亲水蛋白;具有2个糖基化位点和13个磷酸化位点;该蛋白含有一个信号肽,属于分泌型蛋白;含有3个Cu-oxidase保守区,属于Cupredoxin superfamily家族;系统发育树分析表明,BpLAC1蛋白与川桑亲缘关系较近,与柑橘属Citrus、鹰嘴豆属Cicer等亲缘关系相差较远。二级结构中α-螺旋占14.04%,β-转角占11.99%,不规则卷曲链39.51%,延伸链占据34.46%。