浙江乐清铁皮石斛rDNA ITS序列的克隆及序列比对

编号 zgly0000708573

文献类型 期刊论文

文献题名 浙江乐清铁皮石斛rDNA ITS序列的克隆及序列比对

作者 周倩  蒋贤慧  杨晶晶  高必达 

作者单位 湖南农业大学生物安全科学技术学院  植物疾病与利用湖南省高校重点实验室 

母体文献 基因组学与应用生物学 

年卷期 2010,29(3)

页码 513-517

年份 2010 

分类号 Q949.32 

关键词 铁皮石斛  rDNAITS  PCR  克隆  序列比对 

文摘内容 为判断浙江乐清铁皮石斛(Zhejiang Dendrobium officinale)与石斛属(Dendrobium)其它物种的亲缘关系,本文提取了该石斛鲜样的DNA,利用真核生物ITS序列通用引物ITS4/ITS5进行了扩增,并将扩增产物连接转化至大肠杆菌,在对阳性克隆测序。将得到的序列与GenBank上我国石斛属12个组中34个种的rDNAITS进行了比对,并在此基础上构建了系统发育树。序列比对结果表明浙江乐清铁皮石斛的rDNAITS与黄石斛(D.tosaense)一致,其次与铁皮石斛(D.officinale)最相近,序列相似性99%。系统发育树也表明浙江乐清铁皮石斛的rDNAITS序列与黄石斛(D.tosaense)的相似程度高于其与铁皮石斛(D.officinale)的相似程度。本研究将为利用ITS序列鉴别石斛物种种属关系提供参考。