桉树葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)的全基因组分析与进化研究

编号 zgly0000755061

文献类型 期刊论文

文献题名 桉树葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)的全基因组分析与进化研究

学科分类 220.45;经济林学

作者 林元震  张志毅  林善枝  刘纯鑫 

作者单位 华南农业大学林学院  北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点实验室 

母体文献 农业科学与技术: 英文版 

年卷期 2011,12(9)

页码 1276-1278

年份 2011 

分类号 S 

关键词 桉树  葡萄糖-6-磷酸脱氢酶  进化分析  保守基序 

文摘内容 [目的]对桉树基因组中葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)进行全基因组分析与进化研究。[方法]利用巨桉(Eucalyptus grandsis)全基因组数据,采用BLAST等生物信息学软件分析桉树G6PDH的基因特性、蛋白序列、系统进化树以及启动子特征。[结果]桉树基因组内存在6个G6PDH基因,其编码蛋白中,1个为胞质型G6PDH,5个为质体型G6PDH,而且桉树G6PDH均含有保守基序motif1、motif2、motif3、motif7、motif9和motif11。此外,桉树G6PDH启动子序列中均存在TATA框、增强子与涉及光应答、激素应答、胁迫应答等调控元件。[结论]可为下一步研究桉树G6PDH家族基因的分子功能提供参考。