半枫荷叶片转录组特征研究

编号 zgly0001649163

文献类型 期刊论文

文献题名 半枫荷叶片转录组特征研究

作者 田晓明  曾玲珍  颜立红  蒋利媛  向光锋 

作者单位 湖南省森林植物园 

母体文献 湖南林业科技 

年卷期 2018年05期

年份 2018 

分类号 S567.19 

关键词 木本药用植物  半枫荷  转录组  次生代谢  萜类化合物 

文摘内容 半枫荷为特色木本药用植物,药用历史悠久,具有活血通络、祛风除湿、止血化瘀等功效。为探索半枫荷活性成分生物合成的分子基础,本文通过Illumina HiSeq 4000高通量测序技术对半枫荷叶片开展转录组测序分析,共获得了112 361条Contigs,进一步组装得到93 602条unigenes。对半枫荷叶片转录组unigenes进行Blast分析,得到47 798个CDS片段;与Swiss-Prot数据库相比较,得到29 778个蛋白同源序列;与COG数据库比对,有19 279条unigenes被COG功能注释;进行GO功能分类分析,有29 330条unigene注释到GO数据库中;进行KEGG功能注释,发现16 621个unigenes参与了131条代谢通路;通过生物信息学分析,发现多个萜类化合物生物合成途径关键基因。另外,转录组序列中共检测到21 819个SSR位点,其中二核苷酸所占比例最高,达到了47. 93%。研究结果不仅为进一步挖掘半枫荷次生代谢产物合成途径的关键基因提供了丰富的基因资源,同时为半枫荷遗传多样性研究奠定了分子基础。