香蕉α-淀粉酶基因家族的系统进化分析

编号 zgly0001526455

文献类型 期刊论文

文献题名 香蕉α-淀粉酶基因家族的系统进化分析

作者 董晨  贾利强  决登伟  赵秋芳  陈宏良  胡会刚 

作者单位 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室 

母体文献 中国南方果树 

年卷期 2016年05期

年份 2016 

分类号 S668.1 

关键词 香蕉  α-淀粉酶  基因家族  系统进化分析 

文摘内容 α-淀粉酶(Amy)是一类关键的淀粉水解酶,在香蕉果实成熟淀粉降解转化为可溶性糖的过程中发挥着重要作用。本研究基于香蕉基因组数据,通过生物信息学的方法对香蕉α-淀粉酶基因的基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、内含子和外显子结构和保守结构域进行初步的预测与分析,并构建系统发育树。结果表明,编码香蕉α-淀粉酶的基因有12个,根据在染色体的位置命名为MaAmy1~12,MaAmy基因家族编码的氨基酸的范围在79~914个,编码的蛋白相对分子量介于8.8~103.2kD之间,12个MaAmy蛋白中有8个偏酸性,3个偏碱性。不稳定指数分析发现,8个MaAmy蛋白为稳定蛋白;疏水性分析表明,所有的MaAmy蛋白为亲水性蛋白;香蕉MaAmy家族最多的含有13个内含子;进化分析表明,MaAmy家族分4个亚家族。