基于RNA-Seq数据筛选的银叶真藓耐干相关基因表达模式研究

编号 zgly0001568395

文献类型 期刊论文

文献题名 基于RNA-Seq数据筛选的银叶真藓耐干相关基因表达模式研究

作者 梁玉青  李小双  高贝  杨红兰  张道远  管开云 

作者单位 中国科学院新疆生态与地理研究所中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室  中国科学院大学  香港中文大学农业生物技术国家重点实验室 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 Q943.2 

关键词 银叶真藓  耐干  转录组  RT-qPCR  表达模式 

文摘内容 本文以前期获得的银叶真藓在干旱-复水过程中的转录组数据为基础,选择了9个在干旱-复水条件下基因表达差异明显的相关耐干响应基因,并利用荧光定量PCR技术研究其在干旱-复水、ABA诱导胁迫及盐胁迫下的表达模式。研究结果表明,RT-q PCR实验获得的9个基因在干旱-复水下的表达趋势与RNA-Seq基因表达谱中基因表达规律基本一致,因此较好地验证了RNA-Seq数据的可靠性。在干旱-复水过程中,9个基因均不同程度受到干旱和复水诱导表达,但复水阶段基因诱导表达更为强烈,且大多数基因表达量在复水2 h达到高峰,如ERF、Dehydrin(DHN)和HSF3基因等。在ABA和盐胁迫处理下,9个耐干相关基因中有8个同时受ABA和盐诱导上调表达,其中ERF、DHN和LEA基因受ABA和盐胁迫上调表达最为显著。综上,ERF、DHN和LEA等基因同时受干旱-复水,ABA和高盐强烈诱导表达,可作为将来重点研究的抗逆基因。