毛白杨不同组织器官稳定表达看家基因的筛选

编号 zgly0001530999

文献类型 期刊论文

文献题名 毛白杨不同组织器官稳定表达看家基因的筛选

作者 王瑛  陈亚娟  丁莉萍  魏建华  王宏芝 

作者单位 北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心  首都师范大学 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2016年08期

年份 2016 

分类号 S792.117 

关键词 实时荧光定量PCR  内参基因  基因表达水平  毛白杨 

文摘内容 以毛白杨(Populus tomentosa)‘BJHR01’的不同组织器官为材料,运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术及内参基因表达稳定性分析软件Best Keeper、Norm Finder和geNorm分析了8个看家基因在毛白杨不同组织器官中的表达稳定性。所选看家基因包括细胞骨架蛋白肌动蛋白基因(actin)、微管蛋白基因(TUB)、18S核糖体RNA基因(18S rRNA)、翻译延伸因子(EF-1 beta)、翻译起始因子(eIF 5AV)、组蛋白编码基因(H3)、核糖体蛋白基因(RP)和泛素蛋白基因(UBQ),结果发现eIF 5AV、actin和UBQ三个内参基因在毛白杨不同组织器官中表达水平稳定,适合在定量PCR分析中作为内参基因;TUB的表达稳定性最差,不适宜作为毛白杨不同组织器官基因表达研究的内参基因。在毛白杨不同组织器官基因表达水平研究中,可选用eIF 5AV、actin和UBQ三个内参基因的几何平均数作为参照标准,实验数据的分析将更为准确。