1个油茶Y2SK2型脱水素的全长cDNA克隆及生理功能的预测

编号 zgly0001332613

文献类型 期刊论文

文献题名 1个油茶Y2SK2型脱水素的全长cDNA克隆及生理功能的预测

作者 胡孝义  谭晓风  张党权  曾艳铃  陈鸿鹏  田晓明  刘巧 

作者单位 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2008年10期

年份 2008 

分类号 S794.4 

关键词 油茶  脱水素基因  cDNA文库  RACE  生理功能  生物信息学 

文摘内容 以构建的油茶EST文库为基础,采用电子克隆技术,分离克隆一个脱水素基因的全长cDNA序列,该基因的cDNA全长1406bp,含一个600bp的CDS,编码200aa的小分子蛋白。推测该基因编码蛋白的分子质量为21ku,等电点7,暂命名为CoDHNI。同源性分析发现该基因的编码蛋白具有2个Y-片段(DEYGNP),1个S-片段(SGSSSSSS),2个K-片段(KIKEKLPG),属于典型的Y2SK2型脱水素。经Blast比对,发现富含苏氨酸的Thr-区在各物种间变异显著,推测该区为油茶所特有,有利于在被保护的大分子表面形成水合层;同时还发现一个十分保守的基序:EDDGQGGRRKK,可能有利于脱水素的磷酸化和亚细胞定位。通过与柑桔和拟南芥的脱水素比较,提出CoDHNI有可能缓冲种子脱水胁迫响应时钙离子的瞬时增高,并可结合重金属离子,以减轻活性氧的危害。