广西PRRSV分离株GXNN1396全基因序列分析

编号 zgly0001528545

文献类型 期刊论文

文献题名 广西PRRSV分离株GXNN1396全基因序列分析

作者 黄加滨  韦莹  洪绍锋  林思远  何荣祥  陈樱  黄伟坚  韦祖樟 

作者单位 广西大学动物科学技术学院动物传染病研究室  广西陆川县陆透水库管理所 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2016年01期

年份 2016 

分类号 S852.65 

关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒  全基因序列分析  同源性分析  遗传进化分析 

文摘内容 前期我们实验室分离鉴定了一株nsP2蛋白缺失49个氨基酸(aa)的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)GXNN1396株。为了进一步对该毒株全基因组序列特性进行分析,将GXNN1396株病毒在Marc-145细胞上传至第3代,收集细胞上清,抽提该病毒RNA。用RT-PCR检测方法对GXNN1396基因组进行分段扩增、克隆、序列比较和遗传进化分析。结果表明,GXNN1 396全长15 263核苷酸(nt),不包括5′帽子结构和3′Poly A尾。其中,5′非翻译区(5′UTR)长为189nt,3′UTR长151nt,ORF1a、ORF1b、ORF2、ORF3、ORF4、ORF5、ORF6、ORF7分别为7 422、4 382、771、765、537、603、525nt和372nt。与国内外的PRRSV毒株核苷酸序列的同源性进行了比较显示,GXNN1396与欧洲经典毒株LV和VR2332株的同源性分别为61%和88.8%,与TJ、JXwn06、JXA1在全基因上的同源性高达97.2%~97.3%,说明GXNN1396株是一株典型的美洲型PRRSV毒株。遗传进化分析表明美洲型PRRSV主要分为3个亚群,GXNN1396与高致病性PRRSV毒株属于同一分支。