油桐亲环素基因全长cDNA的克隆及序列分析

编号 zgly0000776317

文献类型 期刊论文

文献题名 油桐亲环素基因全长cDNA的克隆及序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 龙洪旭  谭晓风  张琳  谢禄山  陈洪 

作者单位 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室 

母体文献 中南林业科技大学学报 

年卷期 2011,31(12)

页码 111-117

年份 2011 

分类号 S794.3 

关键词 油桐  亲环素  RACE  全长cDNA  序列分析 

文摘内容 亲环素基因广泛分布于各种生命体中,植物亲环素在植物生物学、胁迫应答、抗病原体免疫等方面起重要作用。根据油桐EST文库中的已知部分亲环素基因序列,通过5’RACE和RT-PCR,得到一个油桐亲环素全长cDNA序列。此基因全长为681 bp,包含一个长为519 bp的完整CDS,编码172个氨基酸,将该基因命名为vf_cyp。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白质相对分子量18 038.5 Da,理论等电点8.68。通过预测分析表明该蛋白无跨膜结构,不存在信号肽切割位点,二级结构以β折叠和无规卷曲为主,分别占36.05%和52.91%,具有典型的肽脯氨酰顺反异构酶活性区及植物亲环素基因特有的7个氨基酸插入序列KS/MGKPLH,通过亲缘进化分析表明油桐亲环素氨基酸序列与橙、杂柑、毛果杨亲环素基因的氨基酸序列相似性分别达到94%、94%、93%。