草莓NBS-LRR家族基因FaNBS1的克隆与表达分析

编号 zgly0001397146

文献类型 期刊论文

文献题名 草莓NBS-LRR家族基因FaNBS1的克隆与表达分析

作者 刘建成  段可  李静  叶正文  苏建宇  高清华 

作者单位 宁夏大学生命科学学院  上海市农业科学院生物技术研究所  上海市农业科学院林木果树研究所上海市设施园艺技术重点实验室 

母体文献 果树学报 

年卷期 2011年06期

年份 2011 

分类号 S668.4 

关键词 草莓  NBS-LRR基因  同源克隆  基因结构  进化树  RT-PCR 

文摘内容 利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异和外源植物生长物质处理下的表达变化。该基因在基因组上长为2 434bp,由3个外显子组成的转录本包含长1 893 bp的读码框。所编码蛋白含630个氨基酸残基,在15~146是保守的TIR结构域,191~492是NB-ARC结构域。FaNBS1与大豆TIR-NBS-LRR抗性蛋白ADF78118的全序列一致性为50.20%,在NB-ARC保守结构域的一致性为52.06%。半定量RT-PCR分析显示,FaNBS1在检测的所有组织中都表达,但在茎尖分生组织中表达水平最高,且在叶中的表达水平明显受到外源水杨酸和脱落酸处理的影响。